El Museo Arqueológico de Milán se encuentra en un contexto arquitectónico extraordinario, el antiguo convento del Monastero Maggiore di San Maurizio, fundado en el siglo VIII d.C., donde la historia de la antigua Milán aún muestra sus huellas.

El Museo Arqueológico recoge los testimonios de diversas culturas antiguas . Numerosas obras, de las que se expone una selección en los itinerarios dedicados a la Antigua Milán, proceden de las excavaciones realizadas en la ciudad a partir del siglo XIX. El patrimonio del museo se fue enriqueciendo a lo largo del tiempo con diversas obras, provenientes de donaciones, compras y depósitos. Las colecciones del Museo se exhiben en distintas salas según el contexto cultural al que pertenecen. En la planta baja, pasado el primer claustro dedicado a los edificios públicos, se encuentra la sección Milano Antica. El recorrido continúa en el sótano -sección Gandhara Art y sección Abitare en Mediolanum- y luego en el claustro interno donde se exhiben los epígrafes de la antigua milanesa junto a los restos de la Milán romana (domus, murallas y torres). En el ala nueva, accesible desde el claustro, en la planta baja, junto a la sala de conferencias-didáctica, se encuentra la sección dedicada a Cesarea Marítima (Israel). La sección medieval temprana está en el primer piso, la sección etrusca en el segundo, mientras que el tercer piso está dedicado a la sección griega.

Las colecciones de Egipto, Prehistoria y Protohistoria se exponen en las salas Visconti del Castello Sforzesco.