Le Musée archéologique de Milan est situé dans un contexte architectural extraordinaire, l'ancien couvent du Monastero Maggiore di San Maurizio, fondé au VIIIe siècle après JC, où l'histoire de l'ancien Milan montre encore ses traces.

Le Musée Archéologique recueille les témoignages de diverses cultures antiques . De nombreuses œuvres, dont une sélection est exposée dans les itinéraires dédiés à l'ancien Milan, proviennent des fouilles menées dans la ville à partir du XIXe siècle. Le patrimoine du musée s'est alors enrichi au fil du temps d'œuvres diverses, issues de dons, d'achats et de dépôts. Les collections du Musée sont exposées dans différentes salles selon le contexte culturel auquel elles appartiennent. Au rez-de-chaussée, après le premier cloître dédié aux bâtiments publics, se trouve la section Milano Antica. La visite se poursuit au sous-sol - la section Gandhara Art et la section Abitare à Mediolanum - puis dans le cloître intérieur où sont exposées les épigraphes des anciens milanais à côté des vestiges de la Milan romaine (domus, murs et tours). Dans la nouvelle aile, accessible depuis le cloître, au rez-de-chaussée, à côté de la salle de conférence didactique se trouve la section dédiée à Césarée Maritima (Israël). La section du début du Moyen Âge se trouve au premier étage, la section étrusque au deuxième, tandis que le troisième étage est dédié à la section grecque.

Les collections égyptiennes, préhistoriques et protohistoriques sont exposées dans les salles Visconti du Castello Sforzesco.