Das Museo Nazionale di San Matteo befindet sich im Zentrum von Pisa. Die Geschichte des Museums beginnt mit der lebendigen antiquarischen Kultur in Pisa seit dem 18. Jahrhundert, die mit dem ersten Kern von Gemälden der Primitiven identifiziert wird, die vom Kanoniker des Doms Sebastiano Zucchetti (1796) gesammelt wurden. Die Sammlung, die der Schule für Design zur Verfügung gestellt wurde, wurde im nächsten Jahrhundert um weitere Gemälde und Skulpturen erweitert, die auch durch Erwerbungen aus der napoleonischen und post-unitarischen Zeit wiederhergestellt wurden, wobei sie allmählich in der örtlichen Akademie der Schönen Künste zusammenflossen. Erst im Jahr 1893 richtete Iginio Benvenuto Supino im Kloster San Francesco das neue renommierte Städtische Museum ein, für das er auch einen wertvollen Katalog erstellte. Schließlich entstand 1949 das neue Nationalmuseum, das die Sammlungen des ehemaligen Städtischen Museums mit weiteren Zugängen aufnimmt und sich im restaurierten Kloster San Matteo in Soarta niederlässt. Von dem alten mittelalterlichen Kloster (11. Jahrhundert) sind heute nur noch einige der ursprünglichen Strukturen erkennbar, hauptsächlich in den Innenräumen. In der Mitte des 16. Jahrhunderts wurde das Kloster jedenfalls verändert, wie das Datum im Kreuzgang zeigt, mit toskanischen Säulen und Kapitellen aus Sandstein. Das heutige Eingangsportal des Museums, das dem Lungarno zugewandt ist und neoklassische Inspiration zeigt, stammt wahrscheinlich aus dem späten 18. oder frühen 19. Jahrhundert.