Le Musée National de San Matteo est situé au centre de Pise. L'histoire du musée commence avec la culture de récupération antiquaire vivante à Pise depuis le XVIIIe siècle, qui est identifiée par le premier noyau de peintures primitives collectées par le chanoine du Duomo Sebastiano Zucchetti (1796). La collection laissée à l'usage de l'École de Dessin s'enrichit au siècle suivant d'autres œuvres picturales et sculpturales, récupérées également grâce aux acquisitions domaniales effectuées à l'époque napoléonienne et post-unitaire, avec la fusion progressive dans l'Académie des Beaux-Arts locale. Ce n'est qu'en 1893 qu'Iginio Benvenuto Supino installe le nouveau et prestigieux Musée Civique au couvent de San Francesco, pour lequel il rédige également un précieux catalogue. En 1949, le nouveau Musée National est enfin créé, accueillant les collections de l'ancien Musée Civique avec des ajouts supplémentaires, et s'installant dans le couvent restauré de San Matteo in Soarta. De l'ancien monastère médiéval (XIe siècle), seules quelques structures d'origine sont aujourd'hui identifiables, principalement dans les locaux intérieurs. Au milieu du XVIe siècle, cependant, le couvent a été modifié, comme en témoigne la date dans le cloître, avec des colonnes et des chapiteaux toscans en grès. La façade actuelle du musée, donnant sur le Lungarno, d'inspiration néoclassique, remonte probablement à la fin du XVIIIe siècle ou au début du XIXe siècle.