Das Museum für pathologische Anatomie befindet sich im historischen Zentrum von Pisa. Das Museum ist Teil des Universitätsmuseumssystems der Universität Pisa sowie des Pisaner Museumsnetzwerks. Das Museum für pathologische Anatomie entstand um 1870 als Sammlung anatomischer Stücke von pathologischem und didaktischem Interesse, die einer Leiche entnommen und in mundgeblasene Glasvasen gestellt wurden. Es beherbergt eine bedeutende Sammlung menschlicher und pathologischer Tierstücke von großem wissenschaftlichem Wert, von denen einige aus der großherzoglichen Zeit stammen. In Anbetracht der Anfänge der Sammlungen ist ein Großteil des berichteten Materials von historischem sowie pathologischem und didaktischem Interesse und umfasst in jedem Fall seltene Funde und Präparate. Kürzlich wurden eine Abteilung für forensisch interessante Befunde, gestiftet von der Abteilung für Gerichtsmedizin der Universität Pisa, und eine Abteilung für Paläopathologie mit einer reichen Sammlung paläopathologischer Funde, die verschiedene Knochenpathologien in alten menschlichen Skelettresten veranschaulichen, hinzugefügt von der Etruskerzeit bis zum Mittelalter, das Ergebnis der Forschungstätigkeit der Abteilung Paläopathologie. Teil dieses letzten Abschnitts ist eine präkolumbianische Mumie, die einen Fund von großem Interesse und Anziehungskraft für die Öffentlichkeit darstellt. Das Museum wird derzeit renoviert und nicht alle Funde sind ausgestellt. Während der Notschließung haben das Universitätsmuseum System und auch das Museum für Anatomie und Pathologische Histologie ihren virtuellen Teil zu SMArt erweitert und bieten neue digitale Inhalte.