Le Musée des sciences de la Terre de l'Université de Sienne rassemble les collections cartographiques, géologiques, minéralogiques, pétrographiques, paléontologiques et anthropologiques présentes depuis les années 1960 à l'Institut de géologie et de paléontologie (aujourd'hui Département de physique, de la Terre et de l'environnement). Au fil des ans, les collections ont été organisées et intégrées avec des échantillons didactiques et muséographiques de fossiles, de minéraux et de roches jusqu'à un total de plusieurs milliers d'unités. Parmi ceux-ci, on trouve une importante collection de roches ornementales avec même de grandes dalles rocheuses et de nombreuses aides didactiques et interactives.

Parmi les particularités du Musée, dans la section minéralogique, il faut souligner quelques grands échantillons : un cristal de barytine de plus de 50 cm de longueur qui représente un record mondial pour le Musée, étant le plus grand de cette espèce trouvé à ce jour. Et encore, deux gros échantillons de soufre provenant de mines siciliennes, un échantillon de malachite botroidale de l'ex-Congo et un cristal de quartz, dont des cristaux de shorlite, du Brésil.

Le développement de ces dernières années a permis au Musée des Sciences de la Terre de Sienne d'assumer, en plus de sa valeur institutionnelle, également un rôle informatif en faveur du public externe, consistant en une importante offre éducative. En fait, les activités comprennent l'engagement de valoriser les sites d'intérêt géo-minéralogique significatif et la recherche et la conservation du patrimoine minéralogique de la Toscane et en particulier de la province de Sienne.