Le Musée du Jardin Botanique de Rome est situé dans le jardin du Palazzo Corsini , au pied de la colline du Janicule , dans la zone archéologique des Thermes de Septime Sévère et de son fils Geta. Il se caractérise en effet par des présences architecturales d'un intérêt historique et artistique notable et abrite des collections d' espèces végétales, cultivées en serre et en plein air, de grande valeur (espèces rares ou menacées) et des arbres monumentaux.

Les origines du Jardin botanique de Rome remontent à la papauté de Nicolò III (1277-1280) avec la création d'un pomerium ou verziere, ancêtre de la longue série de jardins du Vatican au sein desquels le Jardin botanique s'est développé.

En 1660, le pape Alexandre VII fit tout son possible pour que l'Université ait son propre jardin botanique , détaché de celui du Vatican et le siège fut établi dans une zone située derrière la Fontana Paolina sur la colline du Janicule. Par la suite, en 1820, le site du Jardin botanique a été déplacé vers le jardin du Palazzo Salviati alla Lungara, car il disposait de structures appropriées pour la culture de plantes et, en 1873, après l'unification de l'Italie, vers le jardin de l'ancien couvent de San Lorenzo à via Panisperna, afin de regrouper tous les instituts scientifiques de la région de Viminale.

L'aménagement définitif du Musée du Jardin Botanique dans le site actuel du jardin du Palazzo Corsini remonte à 1883, lorsque la propriété passa à l'État, avec l'engagement de créer le siège de l' Accademia dei Lincei dans le bâtiment et celui du Botanical Jardin dans le jardin.