El Museo Anatómico de la Universidad de Siena, tal como lo vemos hoy, se creó tras el traslado del Instituto de Anatomía Humana Normal de la antigua sede de los Institutos Biológicos en via Laterina a la actual, en el Polo Científico de San Miniato. Este sitio fue inaugurado en 2001, después de algunas intervenciones de reestructuración, recuperación de los preparados, los modelos didácticos, las tablas anatómicas y parte del mobiliario antiguo.

El Museo Anatómico de Siena lleva el nombre del profesor Leonetto Comparini, quien fue director del Instituto de Anatomía Humana Normal de 1966 a 1997. Ofrece un camino ideal dentro de un Instituto de Anatomía Humana del siglo XIX cuando había figuras profesionales que ahora han desaparecido, como el “sector” (experto en el arte del corte) y el “preparador”, experto en la conservación de órganos que transformó en herramientas didácticas según los pedidos del profesor de Anatomía.

Las colecciones se distribuyen en tres salas y un pasillo.