Die sienesischen Sammlungen antiker medizinischer Instrumente (im Museum für medizinische Instrumente der Universität Siena untergebracht) zeugen von der großen Aktivität der Universität in der Forschung und Lehre der Wissenschaften, insbesondere im Gesundheitsbereich. Sie stammen zum Teil aus dem tausendjährigen Krankenhaus Santa Maria della Scala, Sitz der Medizinischen Fakultät, und aus universitären Einrichtungen.

Die Universität Siena ist seit mehr als zwei Jahrzehnten dank der Tätigkeit des damaligen Zentrums für den Schutz und die Verbesserung des antiken wissenschaftlichen Erbes (CUTVAP), heute das SIMUS-Zentrum, an der systematischen Sammlung, Sicherung, Katalogisierung, Fotografie, Restaurierung, Erhaltung und schließlich Aufwertung wissenschaftlicher Werte. Er wollte daher seinen eigenen Sammlungen historischer medizinischer Instrumente sowie unzähligen privaten Schenkungen ein in zwei Standorte geteiltes Büro widmen: einen Ausstellungs- und Repräsentationsort in der Kirche Santa Maria Maddalena mit einer Auswahl der wichtigsten medizinischen Sammlungen und eine Sammlung von Werkzeugen, die auf Studien- und Forschungsaktivitäten ausgerichtet sind und im wissenschaftlichen Komplex von San Miniato angesiedelt sind.

Darüber hinaus fördert das Museum für Medizinische Instrumente in enger Zusammenarbeit mit dem Zentralinstitut für Katalog und Dokumentation Orientierungs-, Fortbildungs- und Aktualisierungsinitiativen zum kulturellen Erbe, insbesondere im wissenschaftlichen Bereich. Das Museum führt auch wissenschaftliche Überprüfungstätigkeiten für die Archivierungsstellen durch und engagiert sich dank seiner Sammlungen für die Ausbildung und Verbreitung medizinischer Wissenschaften, insbesondere im Hinblick auf die universitäre Bevölkerung der Medizin und Schulen aller Ebenen (ESCAC-Projekt).