Im Inneren des Museums, das in der entweihten Kirche San Lorenzo untergebracht ist, wird das Herz der archäologischen Entdeckungen von Cremona aufbewahrt.

Die über 500 Exponate im Gebäude sind entlang eines thematischen Pfads in drei Abschnitte unterteilt: den öffentlichen Raum, in dem die monumentalen Überreste der Kirche und einige Teile der Gebäude, die für zivile, religiöse und Freizeitzwecke genutzt wurden, hervorstechen, den privaten Raum, der durch die reichen Domus des Labirinto in der Via Cadolini, des Nymphaeums in der Piazza Marconi und der Via Colletta belegt ist, und die Nekropolen, mit Teilen von Denkmälern und Grabbeigaben. Die Besucher des Museo Archeologico können außerdem das Erlebnis genießen, ein Haus aus der Römerzeit zu betreten, indem sie einen Oculus-Viewer verwenden, der es ermöglicht, sich in der virtuellen Nachbildung einiger Räume der Domus des Nymphaeums zu bewegen: das Peristyl, die Speisekammer und ein raffiniertes Schlafzimmer. Im Museum wird besonderer Wert auf Barrierefreiheit gelegt: Es ist mit didaktischen Materialien für Sehbehinderte und Blinde ausgestattet und bietet leicht verständliche Materialien zur Begleitung des Besuchs.