Le Musée Archéologique National de la Lagune de Venise se trouve sur l'île du Lazzaretto Vecchio, lieu d'une valeur historique extraordinaire, située dans la lagune centrale de Venise, très proche du Lido, en face du bassin de San Marco. Il conserve un patrimoine monumental d'un grand intérêt et est un lieu particulièrement fascinant.

En 1423, elle a été choisie par le Sénat de la Sérénissime pour établir - le premier lazaret du monde - un hôpital destiné aux soins et à l'isolement des malades de la peste. L'île a été agrandie à plusieurs reprises, y compris par des remblais des bas-fonds environnants; dans ces zones, des fouilles récentes ont révélé la présence de fosses communes avec des milliers de sépultures.

Vers le milieu du XIXe siècle, elle a été transformée en entrepôt militaire et certains bâtiments ont été démolis; après la fin de sa fonction militaire en 1965, elle a été utilisée comme chenil municipal pendant trente ans. Ces dernières années, l'île a connu d'importants travaux de la part du Ministère des Travaux Publics et du Ministère des Biens Culturels: en 2008, une partie importante des travaux structurels a été achevée avec le projet d'en faire le "Musée Archéologique National de la Lagune de Venise", où reconstruire l'évolution et les transformations de la ville de Venise de l'antiquité à nos jours, en présentant de manière unitaire les considérables matériaux récupérés par des milliers de recherches archéologiques.