Le musée Porziuncola est situé dans la petite ville de Santa Maria degli Angeli, une fraction d'Assise. Le Musée a été fondé en 1920 pour mettre en valeur et conserver les œuvres d'art oubliées dans les dépôts au fil des ans. Le Musée a été réaménagé lors du Jubilé de l'an 2000 suivant un critère d'exposition et retraçant l'histoire de la communauté. L'exposition est divisée en six salles qui développent différents thèmes concernant l'histoire, l'origine de l'ordre franciscain et la construction de la basilique alessienne. Parmi les œuvres les plus célèbres figurent le "Crucifix" de Giunta Pisano, le "San Francesco et les anges" du Maître de San Francesco, la soi-disant "Majesté de San Damiano" attribuée au Maître de la Croix de Gubbio, un tableau avec « San Francesco » Attribué à Cimabue et au XVe siècle « Madonna del Latte ». De grande valeur sont une façade d'autel du XVIIe siècle et un dossal en terre cuite vernissée d'Andrea della Robbia. À l'intérieur du musée se trouve le couvent médiéval, qui est ce qui reste des anciennes cellules des frères. Actuellement, le couvent est utilisé comme lieu d'expositions temporaires d'art sacré.