El nacimiento del Museo Pino Pascali se remonta a 1998 tras una importante donación de obras y objetos pertenecientes al artista por parte de la familia. En 2010, el Museo se transforma en la Fondazione Pino Pascali, coparticipada por la Región de Apulia y el Municipio de Polignano a Mare, con estatutos y reglamentos internos. La sede actual es un antiguo Matadero municipal restaurado, al borde del mar, la casa junto al mar que Pascali tanto anhelaba.

La actividad de la Fondazione se inspira en la figura de Pino Pascali, uno de los exponentes más importantes del Arte italiano e internacional durante los años sesenta, fallecido a los 33 años en Roma, siendo un punto de referencia fundamental para el desarrollo de la actividad expositiva del museo.

La Fondazione está estructurada de manera que trabaja por contenedores con el fin de ofrecer una visión del arte lo más ecléctica y en línea con las principales investigaciones lingüísticas de vanguardia del momento.

Además de un número considerable de obras de Pino Pascali, la Fondazione expone las obras de los artistas puglieses más significativos y las obras de los artistas ganadores del Premio Pino Pascali. La colección permanente y las exposiciones temporales ofrecen al público una oferta cultural en línea con los estándares museísticos más apreciados en el mundo, tanto que en 2013 se le otorgó el Primer Premio como Mejor Fundación de Arte Contemporáneo de Italia.