Die Gründung des Museums Pino Pascali geht auf das Jahr 1998 zurück, als eine bedeutende Sammlung von Werken und Erinnerungsstücken des Künstlers von der Familie übergeben wurde. Im Jahr 2010 wurde das Museum in die Fondazione Pino Pascali umgewandelt, die von der Region Apulien und der Stadt Polignano a Mare gemeinsam getragen wird, mit einer eigenen Satzung und internen Regeln. Der aktuelle Standort ist ein restauriertes ehemaliges städtisches Schlachthaus, das steil über dem Meer liegt, das Haus am Meer, von dem Pascali so sehr geträumt hat.

Die Aktivitäten der Stiftung leiten sich von der Figur Pino Pascalis ab, einem der bedeutendsten Vertreter der italienischen und internationalen Kunst der sechziger Jahre, der im Alter von nur 33 Jahren in Rom verstarb und ein wesentlicher Bezugspunkt für die Entwicklung der Ausstellungstätigkeit des Museums darstellt.

Die Stiftung ist so strukturiert, dass sie als Behälter fungiert, um eine möglichst vielseitige und den wichtigsten avantgardistischen Sprachforschungen der Zeit entsprechende Kunstvision zu bieten.

Neben einer beträchtlichen Anzahl von Werken von Pino Pascali zeigt die Stiftung auch Werke der bedeutendsten Künstler aus Apulien und der Gewinner des Pino Pascali Preises. Die ständige Sammlung und die temporären Ausstellungen bieten dem Publikum ein kulturelles Angebot, das den weltweit geschätzten Museumsstandards entspricht, was dazu führte, dass der Fondazione im Jahr 2013 der erste Preis als beste zeitgenössische Kunststiftung Italiens verliehen wurde.