El Museo y Jardín Botánico de Pisa está ubicado en el centro histórico de la ciudad y forma parte del Sistema de Museos Universitarios de Pisa. El jardín botánico nació en 1543 por iniciativa de Luca Ghini, médico e importante botánico de Imola. Gracias al apoyo del Gran Duque de Toscana Cosimo I de 'Medici fue posible fundar el jardín botánico universitario más antiguo del mundo. Construido originalmente a orillas del río Arno, se trasladó a su ubicación actual en 1591 y luego se amplió gradualmente hasta su extensión actual de unas dos hectáreas. Alberga plantas de los cinco continentes: las suculentas de los desiertos africanos y americanos; las plantas aromáticas del matorral mediterráneo; las especies de los pantanos toscanos; numerosos árboles seculares y muchos otros. Heredera de la antigua Galería, establecida en 1591 por el Gran Duque de Toscana Fernando I de 'Medici, aún conserva la Pinacoteca, compuesta por retratos del siglo XVII de ilustres botánicos, el portal monumental de entrada a la Galería y el " Studiolo" para las semillas del 'Jardín Botánico. También alberga objetos relacionados con la enseñanza de la botánica universitaria desde finales del siglo XVIII. Algunas son verdaderas obras de arte, como las maquetas botánicas en cera y yeso y las tablas didácticas de acuarela (siglo XIX). Otras colecciones son las muestras de plantas in vitro, la xiloteca, las maquetas didácticas, los útiles de botánica y las colecciones paleobotánicas. Finalmente, en el Museo Botánico, gracias a dos estaciones multimedia, es posible realizar un recorrido virtual por las colecciones históricas de plantas del Herbario (Herbarium Horti Botanici Pisani), conservadas en el Palacio del Centro del Jardín Botánico y accesibles sólo para becarios, previa reserva.