El Palacio Poggi , sede del rectorado de la Universidad de Bolonia, conserva algunas colecciones históricas del Instituto de Ciencias , fundado en 1711 por Luigi Ferdinando Marsili.

El Aula Carducci , dedicada al poeta del mismo nombre y donde enseñó, abre el museo del Palacio Poggi : se conservan los muebles originales , así como el busto de bronce realizado en Roma por Bastianelli . Enfrente está la Sala de Hércules , con la estatua homónima en canto rodado esculpida en 1730 por Angelo Piò, ya situada en el patio del edificio.

Palazzo Poggi también alberga el Museo Histórico del Estudio y el octavo centenario que   conserva cientos de documentos del siglo XI, pergaminos, códices, incunables, sellos, títulos, estatutos, donaciones, autógrafos, medallas, insignias rectoral . Entre los muchos recuerdos del museo se encuentra la toga de Luigi Galvani . Además, se exhiben más de una veintena de retratos al óleo y unas seiscientas obras distribuidas en las salas del rectorado y la biblioteca. La colección incluye obras de Donato Creti, Lucia Casalini Torelli, Vandi, Zanotti, Keeble, Crescimbeni , así como el busto de mármol de Eustachio Manfredi, esculpido por el famoso anatomista Ercole Lelli.

El Museo Aldrovandiano del Palacio Poggi conserva una pequeña parte del enorme patrimonio que formaba la colección donada al Senado en 1603. El núcleo Aldrovandiano exhibe, en las vitrinas del siglo XVIII, las espléndidas tablas de acuarela que acompañan los volúmenes de 'Historia Natural' junto con minerales, fósiles, animales secos o disecados, la famosa 'Ranina Aldrovandi', preparados de origen vegetal o animal. Los materiales de las colecciones también incluyen la correspondencia y las obras del naturalista ilustradas por una colección de tablillas grabadas en madera, un rico herbario en dieciséis volúmenes, cuatro retratos, uno de ellos de Palagi, y un retrato en mosaico de Benedicto XIV.

El Museo Marsiliano fue inaugurado en el Palacio Poggi en 1714 y está dividido en dos salas del edificio y está compuesto en gran parte por materiales de papel. Aquí hay manuscritos y obras impresas que documentan los estudios de Marsili desde la antigüedad clásica hasta el arte militar, desde la geografía hasta la etnología y las ciencias naturales. También son visibles maquetas de madera de fortificaciones, así como maquetas de bronce de cañones y morteros de las salas de arquitectura militar del Instituto de Ciencias. De la misma proceden mapas geográficos, manuscritos y dibujos.

El Museo de barcos y mapas geográficos antiguos , organizado dentro del Palacio Poggi , presenta diez modelos muy raros de varios barcos, galeones, buques de guerra hechos del siglo XVI al siglo. XVIII, entre ellos Le Royal Louis, Le Bien Aim (1771) y Le Vainqueur. Una sección del museo recoge importantes placas grabadas en cobre del siglo XVII publicadas en Bolonia, París, Marsella, Ámsterdam e Inglaterra.

La Specola y el Museo de Astronomía se instalaron desde 1979 en tres salas del edificio de la Specola, Palazzo Poggi , que fue construido por el general Marsili en 1702 en la época de Eustachio Manfredi.