Le Museum der Moderne Salzburg a été créé avec la soi-disant Schenkung Welz ("Donation Welz"), une collection d'art graphique moderne. Il a ouvert en 1983 dans le palais de style baroque précoce de l'ancien séminaire catholique le "Collegium Rupertinum" dans la vieille ville de Salzbourg et était initialement appelé la "Galerie moderne et collection d'art graphique - Rupertinum". Son directeur fondateur, Otto Breicha (1983-1998), a élargi sa collection en achetant des exemples de photographie autrichienne. Cette partie de la collection du musée, appelée "Galerie autrichienne de la photographie", comprend également des œuvres du gouvernement fédéral. Sous la direction de Peter Weiermair (1998-2001), le programme du Rupertinum est devenu plus orienté vers l'international.