El Museo der Moderne Salzburg fue creado con la llamada Schenkung Welz ("Donación Welz"), una colección de arte gráfico moderno. Abrió en 1983 en el palacio de estilo barroco temprano del antiguo seminario católico "Collegium Rupertinum" en la ciudad antigua de Salzburgo y inicialmente se llamaba "Galería Moderna y Colección de Arte Gráfico - Rupertinum". Su director fundador, Otto Breicha (1983-1998), amplió su colección comprando ejemplos de fotografía austriaca. Esta parte de la colección del Museo, llamada "galería de fotos austriacas", también incluye posesiones del gobierno federal. Bajo la dirección de Peter Weiermair (1998-2001), el programa del Rupertinum se volvió más orientado internacionalmente.