Le Musée Archéologique d'Héraklion, situé au centre d'Héraklion, est considéré comme le principal musée au monde dédié à la civilisation minoenne, avec la collection la plus complète d'objets de l'ancienne Crète. Inauguré en 1939 et conçu par l'architecte Patroklos Karantinos, il représente un exemple d'architecture moderniste grecque.

Le parcours muséal se développe dans 27 salles thématiques, couvrant une période allant du Néolithique (7000 av. J.-C.) à l'époque romaine. Les principales œuvres exposées incluent : les figures emblématiques des Snake Goddesses, symboles de la religiosité minoenne; Le Disque de Phaistos, mystérieux disque en argile avec des idéogrammes indéchiffrables; Le célèbre pendentif "Bees of Malia", bijou en or raffiné, et la Hache d'Arkalochori, hache votive en bronze gravée; L'impressionnant Vase du Moissonneur, vase en stéatite avec des reliefs représentant des processions ou des scènes sportives; Les vifs fresques du Palais de Knossos comme le "Prince des Lys", le "Taureau sauteur" et d'autres chefs-d'œuvre murals; Le sarcophage de Hagia Triada, unique en son genre pour sa décoration funéraire complète en fresque. 

L'aménagement est technologique et interactif : des textes explicatifs, des maquettes, des modèles 3D, des langues multimédias aident à contextualiser le patrimoine.