La Collection d'anatomie comparée de Bologne est composée de plus de 9 000 pièces qui en font, dans son genre, l'une des plus connues au niveau international tant par la taille que par la rareté des matériaux. Environ 2 500 préparations sont actuellement exposées, réparties en trois parcours.

Le premier, expérimental et premier en Italie, a été mis en place en 1988. Ce chemin consiste en une série de préparations qui peuvent être observées mais aussi touchées accompagnées de légendes également en braille permettant l'utilisation du chemin même pour les aveugles. Les morceaux de ce parcours permettent de développer certains thèmes évolutifs comme la modification des dents en relation avec la nutrition.

La deuxième voie est centrée sur l' évolution et les principales caractéristiques anatomiques des vertébrés.

Le troisième itinéraire est un itinéraire pédagogique dédié avant tout aux étudiants universitaires et qui conserve intact le caractère original de la collection.