El Museo del Herbario fue fundado en 1872 bajo la dirección de Giuseppe De Notaris (1805-1877), una de las figuras más autorizadas en el campo de la Botánica , llamado a Roma para ocupar la cátedra de Botánica en la Universidad, en el momento en via Panisperna.

La disposición actual del Museo del Herbario se remonta a 1938, año en que las colecciones se trasladaron definitivamente a las instalaciones del Instituto Botánico de la Nueva Ciudad Universitaria.

Actualmente el Museo del Herbario consta de numerosas colecciones históricas y contemporáneas , cuya consistencia global se estima en más de un millón de especímenes, evaluación que lo sitúa entre los principales Herbarios italianos y europeos.

El Museo del Herbario , ahora registrado en el Index Herbariorum , una red internacional de Herbarios con el acrónimo RO, está en pleno funcionamiento y sus colecciones están en constante crecimiento: recientemente se han adquirido dos importantes herbarios , el Erbario Fanelli (10.000 ejemplares) . y el Herbario Lattanzi (16.000 ejemplares).

A partir de 2020 entró en pleno funcionamiento el proyecto “ HeRO-Herbarium Ro Online” , que contempla la puesta en valor del patrimonio del Museo Herbario a través de la digitalización y progresiva visualización online de las colecciones del museo .