Das Archäologische Museum befindet sich seit 1897 im Palazzo Giovio, der Stadtresidenz der gleichnamigen Grafen. Das Gebäude stammt aus dem späten Mittelalter, wurde im 16. Jahrhundert umgebaut, erhielt aber im 18. Jahrhundert mit Giovan seine heutige Form Battista Giovio, der auch die Gärten anlegen ließ, mit dem Bau der Treppe und des Nymphäums. Das Museum ist in verschiedene Bereiche unterteilt, die sich hauptsächlich auf die Geschichte der Region Como konzentrieren, wie sie durch die archäologischen Funde der frühesten Spuren menschlicher Besiedlung veranschaulicht wird. Die prä- und frühgeschichtliche Abteilung vermittelt ein besonders gut dokumentiertes Bild der Golasecca-Kultur, die sich im 1. Jahrtausend v. Chr. im Raum Como entwickelte. Die römische Abteilung präsentiert Material aus der von Julius Cäsar gegründeten Stadt Novum Comum und illustriert die wichtigsten Aspekte des damaligen Alltags. Einige Räume sind Sammlungen aus dem 19. Jahrhundert gewidmet, darunter solche, die prähistorische Funde, ägyptische Gegenstände, griechische Vasen, Edelsteine, Münzen und kleine Bronzen beherbergen.