L'ensemble monumental qui abrite le musée est construit sur les structures du théâtre romain et réutilise en partie ses matériaux et ses murs. Le Théâtre romain (Ier siècle avant JC) est utilisé, lors des événements du Festival dei Due Mondi, comme espace de spectacles et de concerts. Le Musée accueille des événements liés à l'alternance école-travail et à la collaboration avec la municipalité de Spolète ; visites guidées thématiques ; des conférences (dont le cycle annuel, également prévu en 2018, Raconter l'histoire) ; présentations de livres; concerts; expositions temporaires (dont, en 2017, des crèches artistiques) ; laboratoires et cours de formation. Suite au séisme, des mesures de sécurité ont été prises sur la structure. Grâce à des découvertes provenant également des recherches les plus récentes, sont documentées les premières attestations de présence humaine dans la zone de la forteresse et du centre historique, remontant à l'âge du bronze, et le développement de l'habitat dans la phase ombrienne, mis en évidence. surtout par les riches objets du VIIe-VIe siècle J.-C. de la nécropole de la Piazza d'Armi.