La vaisselle pharmaceutique constitue un élément important de la collection, notamment en raison de sa grande quantité. Elle a été donnée à la commune par l'Ente Ospedaliero di Gubbio. Depuis le Moyen Âge, la céramique a été, avec le verre, le matériau préféré pour conserver les herbes, les épices et les nombreux composants des préparations médicinales, en raison de sa praticité et de sa facilité de nettoyage. À partir de la moitié du XVe siècle, l'habitude s'est installée d'écrire directement sur les pots le nom du produit qu'ils contenaient, ou de laisser vide la cartouche pour y apposer une étiquette en papier. Le corpus le plus ancien de la collection est principalement composé de verseurs pour les médicaments liquides (pots ventrus avec un col cylindrique et un bec en tube) et de la série d'albarellos (forme cylindrique avec un rétrécissement au centre et un court col destinés aux préparations épaisses, huileuses et épicées). Pour compléter la collection, une série de creusets et de dômes d'alambic en terre cuite utilisés pour la distillation.