Un élément précieux des collections du musée est la collection historique de papillons de nuit du Paléarctique occidental, provenant de l'ancien Institut national d'entomologie (INE) fondé par le comte Federico Hartig. La collection, conservée dans les armoires d'origine, remonte à la première moitié de des années 1900 et comprend plusieurs dizaines de milliers de spécimens et des dizaines de types primaires.