La colección permanente del museo Palazzo Doebbing está dividida en áreas temáticas. Una está dedicada al arte antiguo y alberga artefactos de la época romana, entre los cuales destaca el Efebo del siglo I d.C., como testimonio de la milenaria identidad sutrina. También hay una sección dedicada al arte sacro que conserva y valora una preciosa selección de obras del tesoro de la Catedral.

Por último, la galería de arte con lienzos y tablas procedentes de diferentes edificios de la Diócesis de Civita Castellana, entre los cuales destacan obras maestras de artistas como Antoniazzo Romano, Sano di Pietro y Antonio da Viterbo. El museo alberga durante el año numerosas exposiciones siempre incluidas en el precio de la entrada sin costos adicionales.