Der Überlieferung nach wurde San Tommaso in der Burg aus dem 13. Jahrhundert des mittelalterlichen Dorfes Aquino geboren. Das Haus wurde wahrscheinlich von einem örtlichen Magistrat bewohnt: Tatsächlich ist in der Nähe des Portals die in Stein gemeißelte Inschrift "Tomas iudex" sichtbar, die im Laufe der Jahrhunderte zu naiven Missverständnissen geführt hat. Das Dorf liegt auf einem großen Felsvorsprung im Tal, das vom Fluss Liri durchquert wird. Das Zentrum hat sehr alte Ursprünge, ist aber ungewiss datiert. Es wurde zu einem wichtigen Handels- und Produktionszentrum entlang der antiken Via Latina. Im Museum ist die ikonografische Dauerausstellung „Leben des hl. Thomas von Aquin“ eingerichtet, in der vier Originalblätter des flämischen Künstlers Otto Van Veen, eines Rubensschülers, aus dem Jahr 1610 ausgestellt sind, die Episoden aus dem Leben des hl. Thomas darstellen. Die Besuchsroute zeichnet die persönlichen Ereignisse des Heiligen nach, vor allem sein philosophisches und theologisches Denken, das jahrhundertelang die größte Referenz für die katholische Lehre darstellte.