Sur la Piazza Eremitani se dresse le complexe des Musées Civiques qui regroupe le Musée Archéologique et le Musée d'Art Médiéval et Moderne. Les Musées sont installés dans les cloîtres de l'ancien couvent des frères Eremitani. La chapelle Scrovegni et le palais Zuckermann font partie du complexe.

Le bâtiment conçu par Franco Albini, un architecte bien connu qui a remporté le prix Olivetti pour l'architecture en 1957, se dresse à côté de la partie survivante de l'amphithéâtre romain entre la chapelle Scrovegni et l'église Eremitani. L'itinéraire d'exposition du musée archéologique commence par les découvertes préromaines de la nécropole de Padoue, datant du VIIIe au IIIe siècle avant J.-C. le beau buste de Silène, la pierre funéraire raffinée de la jeune danseuse Claudia Toreuma et le sanctuaire funéraire monumental des Volumniens. D'autres salles sont réservées aux matériaux étrusques, grecs et italiotes. Deux salles égyptiennes sont dédiées au pionnier de l'égyptologie de Padoue, Giovan Battista Belzoni. Le cloître abrite à la place la riche collection lapidaire, composée de colonnes, trabéations, chapiteaux, frises, éléments architecturaux, principalement trouvés dans la région des Collines Euganéennes et de Padoue. En 2008, le tronçon dédié à la Via Annia a été inauguré, la grande route construite à l'époque romaine pour relier le nord-est de l'Italie au reste du réseau routier de la péninsule.