La Crypte du Péché Originel était le lieu de culte d'un monastère rupestre bénédictin de l'époque lombarde. Il est agrémenté d'un cycle de fresques datées entre les VIIIe et IXe siècles, peintes par l'artiste connu comme le Peintre des Fleurs de Matera et exprimant les caractéristiques historiques de l'art bénédictin-bénéventin. Le mur de gauche est animé par trois niches, sur lesquelles sont respectivement représentés les triarchies des Apôtres, de la Vierge Reine et des Archanges. Le mur du fond, quant à lui, est animé par un grand cycle pictural illustrant des épisodes de la Création et du Péché Originel.