Il représente le frère franciscain Luca Pacioli, mathématicien et étudiant des proportions, alors qu'il réalise l'un des problèmes de géométrie rapportés dans les Éléments d'Euclide. À côté de lui, un jeune homme élégant qui pourrait être identifié avec Guidobaldo da Montefeltro. Sur la table verte sont disposés les outils du métier, le compas, le rapporteur, la craie, l'éponge, le livre ouvert d'Euclide et un fermé sur lequel se détachent les lettres LI.R.LUC.B, à dissoudre avec cette inscription : Liber reverend Lucae Burgenis, qui ferait référence à la Summa de Arithmetica, Geometria, Proportione, traité mathématique de Luca Pacioli, publié à Venise en 1494 et dédié à Guidobaldo. Suspendu à un fil pend un polyèdre transparent qui reflète un bâtiment très similaire au Palais Ducal d'Urbino.