Santa Giustina, martyre à Padoue en 304, appartenait à l'ancienne famille Vitaliani, puis fusionnée avec la famille Borromeo au début du XVe siècle. Peint vers 1470, le panneau est donc documenté à Milan, au Palazzo Borromeo, en 1513. Puis, pendant plus de trois siècles, ses traces se perdent jusqu'à ce qu'à la fin du XIXe siècle, il réapparaisse dans la collection Bagatti Valsecchi. Entre-temps, même son auteur avait été perdu ; en 1913 ce sera le grand historien de l'art Bernard Berenson, qui attribua d'abord le tableau à Alvise Vivarini, pour nommer Giovanni Bellini, soulignant la solennité absorbée et statuaire du Saint, que l'on retrouve dans d'autres œuvres contemporaines du Maître.