La toile, dont l'origine est encore inconnue, a été inscrite en 1921 à l'inventaire du Palazzo Bianco comme copie de Lionello Spada da Caravaggio. En 1953, il a été identifié par Caterina Marcenaro et, l'année suivante, il a été publié par Roberto Longhi comme la version dédicacée du maître lombard dont des copies dérivées ont été tirées, en particulier de la région sicilienne. Diverses hypothèses ont été formulées concernant la commande et la provenance ancienne de ce tableau, mais il n'existe toujours pas certains éléments permettant de reconstituer les événements de l'œuvre jusqu'à sa découverte dans les dépôts génois. L'une des hypothèses les plus accréditées liait l'Ecce Homo du Palazzo Bianco à l'œuvre que le Caravage lui-même, dans un écrit autographe daté de juin 1605, avait promis au noble romain Massimo Massimi, figure éminente de la Rome contre-réformée ; d'autres études, en revanche, ont proposé d'identifier cette toile avec celle déjà présente dans la collection génoise de Pietro Gentile ; avec celui mentionné dans le testament du citoyen génois Lanfranco Massa, rédigé à Naples en 1630, ou avec celui qui apparaît méticuleusement décrit dans l'inventaire de la collection napolitaine de l'Espagnol Juan de Lezcano (en 1631). Au-delà des diverses hypothèses, donc, le seul fait incontestable peut être vu dans les nombreux "repentis", visibles dans les mains de Pilate, dans les épaules, dans les mains et dans le pagne du Christ qui prouvent la rapidité d'exécution de l'œuvre . Cependant, le tableau aurait dû arriver tôt à Gênes. Pour renforcer cette dernière possibilité, il ne fait aucun doute que des références formelles précises à la composition du Caravage se trouvent dans les œuvres d'artistes actifs à Gênes déjà dans les premières décennies du XVIIe siècle, tels que Strozzi, Borzone, Orazio De Ferrari et Van Dyck, qui a immédiatement capté le caractère innovant des choix d'éclairage. Comme dans le Caravage, en effet, également dans ce tableau - dans lequel les échos de la formation lombarde du peintre sont évidents - les lumières et les ombres sont chargées de significations symboliques de sorte que dans la lumière lumineuse du corps du Christ, représenté dans l'attitude résignée du Agnus Dei, le noir de la robe de Pilate y contraste, ce qui renforce, même visuellement, le rôle négatif du procureur romain en tant que juge. Le geste éloquent des mains de ce dernier, invitant alors les spectateurs à entrer dans la scène dépeinte au-delà du parapet, donne à l'épisode les caractéristiques d'un « drame sacré » figuratif.
