La Madonna del Lazzaretto est l'un des chefs-d'œuvre du Musée des Capucins : en elle-même, elle présente des éléments évidents d'art et de foi.
Produite par l'atelier florentin d'Antonio Rossellino, les circonstances de son arrivée à Milan sont inconnues, mais il semble qu'elle ait été placée sous l'une des arcades de l'hôpital pour être vénérée par les malades. En fait, il semble qu'il se trouvait déjà à l'hôpital lorsque l'utilisation de ce lieu pour l'isolement des malades contagieux a cessé. A cette époque (après 1633), il fut donné aux frères capucins du couvent de la Porta Orientale en remerciement pour l'important service d'assistance effectué à l'intérieur de l'hôpital.
Par la suite, avec la suppression puis la démolition du couvent de la Porta Orientale (1810), la tuile fut acquise par des particuliers qui en furent les gardiens pendant environ un siècle. C'est donc dans les années 1920 que les frères capucins du nouveau couvent de Viale Piave reçurent en cadeau cette Vierge à l'Enfant qu'ils placèrent dans le chœur de l'église. Suite à quelques adaptations du chœur et de la zone du presbytère, le panneau avec la Madonna del lazzaretto (appelé ainsi en raison de sa provenance ancienne) a été transféré d'abord au couvent, puis au dépôt du Musée des Capucins.

En 2007, il a subi une délicate restauration qui a mis en lumière le film pictural original avec la décoration riche en or dans de nombreuses parties. L'Enfant est vêtu d'une tunique verte et tient maladroitement dans ses mains potelées un chardonneret qui fait référence à la Passion, tout comme les bijoux en corail rouge qui ornent le cou et le poignet gauche font référence à la passion.
La Madone porte une robe rouge finement décorée et ce qui frappe c'est le regard à la fois souffrant et presque détaché de celui avec qui elle regarde le fils qu'elle tient à côté d'elle. Il sait le destin qu'il vivra.