La section botanique du Musée Calderini est principalement représentée par les collections du botaniste valsésien Antonio Carestia (1825-1908), l'un des plus grands spécialistes de la flore valsésienne ainsi qu'un botaniste de renommée internationale. L'abbé Carestia a livré une partie de l'herbier qu'il a créé en mai 1870, continuant dans les années suivantes à augmenter la collection de phanérogames qu'il avait constituée avec d'autres spécimens, ajoutant également des collections de cryptogames, d'algues et de lichens.

Le catalogage et la numérisation récents des dossiers et des feuilles d'herbier qui composent l'œuvre de l'abbé valsésien, accompagnés d'une revue critique des spécimens, ont permis une meilleure clarification des déterminations originales et une quantification des échantillons du musée : l'herbier de propriété de l'institution naturaliste est ainsi composée de 1050 feuilles et colis, avec 1427 espèces représentées et pour un total de 1995 spécimens.