La fondation mythique de l'église est attribuée à la figure de Pertarito, un prétendant au trône lombard, qui s'est sauvé d'une conspiration pour l'usurpation du trône, et en 673 a érigé un monastère féminin sur le site de sa fuite. Au centre de la fresque se trouve la Vierge, en train d'être couronnée par le Christ, insérée dans une architecture complexe, conclue par trois niches, dont la centrale abrite la colombe du Saint-Esprit, surmontée du Père Éternel tenant le Crucifix. Six anges musiciens sont disposés symétriquement sur le socle en marbre à décors géométriques. Les saints François et Claire, fondateurs de l'ordre auquel appartenait le monastère (franciscain à partir de 1230), représentaient à droite avec leurs attributs et vêtements monastiques, et à gauche les saints Primo et Feliciano, dont les reliques étaient conservées dans l'église. Sous l'arc de triomphe, dans des cadres grotesques, les Quatre Docteurs de l'Église d'Occident assis à leurs pupitres. En 1895, la fresque de l'abside est détachée et vendue clandestinement à George Gray Bernard, sculpteur et collectionneur américain, par l'antiquaire parisien Raoul Heilbronner. La fresque est arrivée au Philadelphia Museum of Art en 1945 et restituée par ce dernier à la ville de Pavie : en 1991, elle a été généreusement offerte aux Musées civiques et est depuis exposée dans la section romane et renaissance de notre musée.