El Museo Portuario Alemán está ubicado en el puerto libre, en el último complejo de muelles que hoy queda bajo protección. La estructura del muelle se construyó hace 100 años y garantizaba el movimiento óptimo de mercancías entre el barco amarrado en el muelle y el tráfico en tierra. Hasta finales de los años 60, el tráfico sudamericano se gestionaba en el muelle de Bremen. Hoy en día las terminales tienen una estructura totalmente diferente debido al uso de contenedores. En ningún otro lugar podrá experimentar la atmósfera del puerto antes de su introducción como en el Museo del Puerto, un fascinante lugar de descubrimiento.
El emplazamiento alrededor de los almacenes históricos será en el futuro uno de los dos edificios del Museo Portuario Alemán. El nuevo edificio se construirá en Kleiner Grasbrook. Gracias a las dos ubicaciones, el museo puede cubrir áreas temáticas y ofertas de mediación muy diferentes.