En el corazón del centro histórico de Coímbra, el Museo de Ciencia se encuentra en dos edificios históricos: el Laboratorio Químico (siglo XVIII, reformas pombalinas) y el Colegio de Jesús (antiguo colegio de los Jesuitas), fusionados en un moderno museo inaugurado en 2006.

El museo alberga las colecciones científicas más prestigiosas de Portugal, que incluyen instrumentos para la física experimental, botánica, zoología, mineralogía, antropología y astronomía. Destacan el Gabinete de Física, galardonado en 2016 con el reconocimiento de "Sitio Histórico Europeo" por la Sociedad Europea de Física, y la Galería de Historia Natural, que conserva especies botánicas, fósiles, animales embalsamados y modelos didácticos que datan del siglo XVIII.

La exposición permanente "Secretos de la Luz y la Materia" propone un recorrido interdisciplinario interactivo: experimentos, modelos y soportes multimedia guían a los visitantes en el descubrimiento de los fenómenos científicos fundamentales.