Das Nationale Archäologische Museum von Civitavecchia befindet sich in dem von Papst Clemens XIII. im Jahr 700 erbauten Gebäude, nur wenige Schritte vom Fort Michelangelo entfernt. Es beherbergt eine bemerkenswerte Sammlung von archäologischen Funden aus den antiken Centumcellae und Funden aus dem archäologischen Gebiet des nahe gelegenen Monte Rovello. Das Museum präsentiert einen dreistöckigen Rundgang mit archäologischen Zeugnissen von den Anfängen der Zivilisation über die Antike bis zum Mittelalter. Zu den interessantesten Funden im Erdgeschoss gehört eine Statue des Gottes Apollo (1. Jahrhundert n. Chr.), die bei Ausgrabungen in der Villa Simonetti in Santa Marinella, der antiken Sommerresidenz des römischen Juristen Eneo Domizio Ulpiano, gefunden wurde. Höchstwahrscheinlich handelt es sich um eine Reproduktion des Kolosses von Rhodos. Von besonderer Bedeutung ist auch eine Reproduktion von Phidias' Athena Parthenos aus der Mitte des 2. Jahrhunderts. d. C. und einige Marmorköpfe, darunter einer, der den Kaiser Marcus Aurelius als jungen Mann darstellt. Im ersten Stock des Museums befinden sich Keramik- und Bronzefunde, die hauptsächlich aus der Gegend um Civitavecchia (Tolfa, Allumiere, Luni sul Mignone und Santa Severa) stammen, sowie einige Beispiele von Bucchero Estrusco. Nicht fehlen dürfen auch einige Metallfunde mit einem Bronzering und einem Goldohrring von erlesener Raffinesse.