Il Museo Diocesano Carlo Maria Martini fa parte del complesso dei Chiostri di Sant’Eustorgio. Venne inaugurato nel 2001 dal Cardinale Carlo Maria Martini a cui è poi stato intitolato nel 2017. La collezione permanente del Museo Diocesano è costituita da ormai quasi mille opere, comprese tra il II ed il XXI secolo. La collezione è il risultato di diversi lasciti e donazioni che offre un interessante panorama della storia collezionista arcivescovile e privata. Le collezioni sono attualmente allestite lungo i tre corpi restaurati del secondo chiostro di Sant’Eustorgio e sono in continuo arricchimento. Fanno parte della collezione permanente anche le opere di Lucio Fontana, il Tesoro di San Nazaro e i Fondi Oro della Collezione Crespi, una delle più significative della diocesi ambrosiana. Oggi il Museo Diocesano Carlo Maria Martini ospita mostre temporanee ed eventi culturali.