L’appartamento nobile costituisce la parte più prestigiosa del Museo del Palazzo. Gli ambienti presentano un percorso di visita che sviluppa due piani di lettura paralleli e integrati. 
Da una parte le decorazioni affrescate sui muri delle sale, datate tra la metà del Quattrocento e i primi anni del Cinquecento, opera di Giovanni del Sega e Bernardino Loschi, pittori di corte di Alberto III Pio; dall'altra le opere rinascimentali, già parte delle collezioni dei Musei di Palazzo dei Pio, qui esposte.