Il Museo di Storia Naturale dell’Università di Pisa si trova a Calci, un paese della provincia di Pisa. Il museo venne fondato nel 1591 e fa parte dei Musei d’Ateneo dell’Università di Pisa. Il Museo nacque per volontà di Ferdinando I de’ Medici, il quale istituì una Wunderkammer (camera delle meraviglie) con oggetti naturali bizzarri e molto rari. La wunderkammer comprendeva tutti i reperti collezionati da Ferdinando I de’ Medici durante i suoi viaggi in tutta Europa.
Nel corso del tempo la collezione si arricchì notevolmente grazie a nuove acquisizioni e donazioni private.
Oggi il percorso espositivo, completamente riorganizzato, comprende delle sezioni di monotremi, marsupiali, carnivori e la Galleria degli erbivori. Il percorso termina con la Wunderkammer di Ferdinando I de’ Medici, così come venne concepita ed arredata da lui nel Cinquecento e Seicento. Di grande interesse sono sicuramente i crani di un bucero rinoceronte e di un bucero cespuglioso, rari uccelli delle Indie orientali e due conchiglie lavorate in oro.
Il Museo ospita mostre temporanee di tipo scientifico e naturalistico.