Le musée des sciences naturelles Enrico Caffi de Bergame est situé dans la ville haute et abrite une vaste collection de collections consacrées aux disciplines naturalistes. Le Musée est né en 1871 même si la date d'inauguration officielle remonte à 1918. Le Musée se compose de trouvailles et d'objets qui ont été donnés entre 1860 et 1870 par les professeurs de l'Institut Royal Technique dont l'intention était de les réunir en un seul endroit et les rendre accessibles au public citoyen. Le premier directeur de l'institution fut le prêtre Enrico Caffi, à qui le musée fut renommé en son honneur. Caffi a dirigé le musée jusqu'en 1947 et a considérablement augmenté le nombre d'artefacts de la collection. En 1960, les collections du musée ont été transférées au Palazzo Visconteo, siège actuel du Musée. Le Musée est composé de différentes sections : zoologique, entomologique, géologique, paléontologique et ethnographique. Le Musée est également connu pour la richesse des activités didactiques et interactives qui peuvent être réalisées à travers les ateliers. De plus, il y a un chemin avec des écrits en braille pour les aveugles.