Die prähistorische und frühgeschichtliche Abteilung des Museums veranschaulicht die Entwicklung der menschlichen Besiedlung von den ersten Dörfern, die über das Territorium verstreut sind, bis zur Gründung des ersten bewohnten Kerns in der Eisenzeit. Zu den wertvollsten Stücken gehört die silberne Falera, geprägt, aus der Mitte des 1. Jahrhunderts v. Chr., die im Geschirr von Pferden verwendet wurde, um die Kreuzungen des Geschirrs zu bedecken. Es ist am Band mit stilisierten Menschenköpfen geschmückt.

Unter den reichen bildhauerischen Ausstattungen der Basilika San Salvatore stechen zwei trapezförmige Platten aus prokonnesischem Marmor durch ihre Raffinesse und Präzision hervor, die zwei Pfauen darstellen. Während eine Platte unversehrt zu uns gekommen ist, sind nur wenige Fragmente der anderen besessen. Das Werk ist reich an symbolischen Werten, gemäß einer im frühen Mittelalter wiederkehrenden Ikonographie frühchristlichen Ursprungs, die dem Pfau die allegorische Bedeutung der Auferstehung und Unsterblichkeit der Seele zuschreibt. Die Reben, die sie umgeben, werden traditionell auf das Symbol der Passion Christi zurückgeführt. Wissenschaftler glauben, dass die beiden Platten als Brüstung für die Zugangstreppe eines Ambo im Inneren der Kirche dienten, der zum Lesen heiliger Texte und zum Rezitieren von Predigten geeignet war.

Die Lipsanoteca, die in der unteren Halle von Santa Maria in Solario aufbewahrt wird, war Teil der sogenannten Schatzkammer von Santa Giulia, einer Sammlung seltener liturgischer Gegenstände, die auf die Anfänge des Klosters zurückgeht. Es handelt sich um eine rechteckige Elfenbeinschatulle, die als Schutzhülle für Reliquien dienen sollte, wie aus der Etymologie des Namens hervorgeht, griechischen Ursprungs, bestehend aus leipsanon, was Reliquie bedeutet, und théke, oder Behälter. Es wurde in der zweiten Hälfte des vierten Jahrhunderts von einer Werkstatt in Norditalien, wahrscheinlich Mailänder, unter dem Episkopat von Sant’Ambrogio hergestellt. Der Reichtum des Materials, die hohe Ausführungsqualität und die Kostbarkeit der Dekoration bestimmen die Bedeutung und Seltenheit dieses Artefakts.

Unter den wertvollsten Stücken der römischen Abteilung des Museums sticht eine Reihe kaiserlicher Porträts in Bronze hervor, die 1826 in den Ruinen des Kapitols gefunden wurden.

Das Kloster San Salvatore - Santa Giulia wurde auf den Überresten eines Wohngebiets aus der Römerzeit erbaut, das heute teilweise in die Besichtigungsrouten des Museums mit der Domus dell'Ortaglia (der Domus von Dionysos und der Domus der Brunnen) integriert ist. . Das Triklinium (Speisesaal) der Domus des Dionysos war der reichste Raum mit Fresken und ist berühmt für den Erhaltungszustand seines Bodenmosaiks mit dem Bild des Gottes, der einen Panther trinkt, in der Mitte.

Unter dem Sternenhimmel von Ferramola, im oberen Saal des Oratoriums Santa Maria in Solario, erstrahlt das Kreuz des Desiderius, ein Meisterwerk der karolingischen Goldschmiedekunst aus dem 9. Jahrhundert n. Chr. Das Kreuz, das Andachts- und Prozessionsfunktionen hatte, stellt eines der seltensten liturgischen Exemplare dar, das uns sowohl wegen seiner beträchtlichen Größe als auch wegen der großen Menge an Edelsteinen, insgesamt 212, symmetrisch verstreut auf der hölzernen tragenden Struktur, überliefert ist mit einem Metallblech, mit an den Enden erweiterten Armen. Das Kreuz, ein Werk hoher Goldschmiedekunst, sollte nicht nur die Fülle der christlichen Hingabe an Christus den Erlöser darstellen, sondern auch die Rolle der herrschenden Dynastien in einem kontinuierlichen Spiel von Querverweisen zwischen imperialer Macht, römischem Erbe und religiöser Sehnsucht, überirdisch Ruhm und weltliche Symbole. Allein die Entscheidung, das Kreuz mit Edelsteinen zu schmücken, wie es bei der Kaiserkrone der Fall war, stellt einen klaren Hinweis auf den Wert und die Macht der Kirche dar, die nicht der des Kaisers nachstehen.